医院前身系国民政府中央医院，1929年建于南京，1941年迁至重庆，1950年正式命名，现为第三军医大学*附属医院、*临床医学院。
特色科室/西南医院拥有国家重点学科10个(烧伤科、肝胆外科、感染病科、泌尿外科、神经外科、骨科、胸心外科、整形外科、心血管内科、呼吸内科)，国家重点培育学科2个(消化内科、眼科)；国家中医药管理局重点学科1个(中西医结合科)，全军医学研究所7个(烧伤科、肝胆外科、感染病科、泌尿外科、消化内科、神经外科、病理科)，全军医学专科、专病中心7个(骨科、眼科、普通外科、检验科、妇产科、心血管内科、康复理疗科)，全军卫生信息基地1个，国家重点实验室2个，“组织工程国家地方联合工程实验室”1个。
医护团队/西南医院专业技术人员5000余人，其中高级职称405名，享受政府特殊津贴专家44名，“973”首席科学家4名，长江学者1名，国家杰出青年基金获得者4名，博士生导师79名，硕士生导师166名。
