在泥鳅养殖过程当中，如果出现较多的病虫害，就会导致泥鳅的存活率大大降低，进而影响到养殖者的泥鳅养殖利润，所以在养殖的过程中，一定要掌握正确的防治病虫害的方法，针对不同的病虫害，能够采取不同的方法来进行防治，使泥鳅能够健康生长。
一、赤鳍病
在泥鳅养殖过程中一些微生物的存在，会使得泥鳅养殖基地出现一种叫做赤鳍病的病虫害，这种病虫害对泥鳅产生的危害非常的大，有这种病虫害存在的话，泥鳅的体表表皮就会出现剥落的情况，而且身体呈现出灰白色，泥鳅的肌肉也开始出现腐烂，它的肛门部位出现发红的情况，接下来便会出现一些血斑，如果这种病虫害比较严重的话，泥鳅就会出现不进食的情况，时间长了便会死亡了。这种病在夏季的时候出现得比较多，在饲养泥鳅的过程中，为了避免这种病虫害的出现，在投放泥鳅之前，应该把泥鳅苗都用百分之四的食盐水行消毒处理，以减少病虫害的发生，如果在饲养的过程中出现了这种病虫害，那么可以在鉰料当中拌入一些氯霉素，再对泥鳅进行喂食。
二、寄生虫
还有一种是寄生虫引起的病虫害，这种病虫害出现之后，会使泥鳅的进食量大大减少，而且它不再喜欢和其它的泥鳅一起群居，而喜欢游离在群体之外，这种病虫害一般在泥鳅的鳃部和体表处存在，如果不及时进行治疗的话，也可以导致泥鳅死亡，它发病的时候一般是在五月份到八月份之间，要想预防这种病的出现，一般需要用生石灰对池塘进行清塘处理，然后还要在池塘底部喷洒晶体敌百虫，在喷洒的时候，要对整个池塘底部进行全面的喷洒，以便可以更好地将寄生虫消灭。
泥鳅在养殖的过程中，还会遇到一些其它的病虫害，养殖者在面对不同的病虫害的时候，需要采取不同的方法来对病虫害进行防治，只有掌握正确的防治病虫害的方法，才能使泥鳅更好地生长。